Survey
* Your assessment is very important for improving the workof artificial intelligence, which forms the content of this project
* Your assessment is very important for improving the workof artificial intelligence, which forms the content of this project
Aminoacyl tRNA synthetase (aaRS) Oleh: Ertanti Rizki P. 20512033 Suci Rizki Nurul Aeni 20512044 KK Biokimia-Institut Teknologi Bandung Outline What is aa RS ? What the development? How kinetics parameter of aa RS ? What is aa RS ? Lokasi Fungsi defisiensi Berperan dalam proses • Kesalaham Koding translasi RNA Asam amino PL • Protein berubah jenis dan fungsi Pengikatan asam amino Terdapat dalam sel makhluk hidup, yaitu pada Ribosom spesifik ke tRNA Tahapan pengikatan tRNA dengan asam amino 1) Sisi aktif enzim mengikat asam amino dan molekul ATP. 2) ATP kehilangan dua gugus fosfat dan bergabung dengan asam amino sebagai AMP. 3) tRNA berikatan kovalen dengan asam amino menggeser AMP di sisi aktif enzim. 4) Enzim melepaskan tRNA-aminoasil, disebut juga “asam amino teraktivasi” Mekanisme Perbedaan Kelas Asam Amino Kinetika kinetic of Enzyme • • • • • Suhu Konsentrasi enzim Konsentrasi Substrat Inhibitor Jumlah Pyrophosfat What the development? • Inhibitor enzim ini dapat berguna bagi treatment untuk beberapa penyakit antara lain Malaria dan HIV 1 • Inhibitor enzim ini berpotensi untuk zat antibiotik Spesific Enzyme Name of IUBMB • EC 6 • EC 6.1 • EC 6.1.1 • • • • : Class Ligase : Subclass Forming Carbon-Oxygen Bonds : Ligases forming aminoacyl-tRNA and related compounds EC 6.1.1.11 : Serine-tRNA ligase Nama lain : seryl-tRNA synthetase; SerRS; seryltransfer ribonucleate synthetase; seryl-Transfer RNA synthetase; seryl-transfer ribonucleic acid synthetase; serine translase Nama Sistematik : L-serine:tRNASer ligase (AMP-forming) Serine-tRNA ligase Fungtion • Mengakatalisis pengikatan kovalen dari serin ke gugus 3’-OH dari nukleotida tRNA-nya dalam suatu proses yang digerakan oleh hidrolisis ATP. Reaction of Serine-tRNA ligase ATP + L-serine + tRNASer AMP + diphosphate + L-seryl-tRNASer Characteristic of Serine-tRNA ligase • Terdapat dua domain yang terikat pada active side dan pada antikodon • Domain N-terminal terdiri dari rantai yang sangat panjang • Seryl-tRNA synthetase memiliki setidaknya lima spesies yang berbeda yang secara kolektif mengakui enam kodon berbeda untuk asam amino Kinetic of Serine-tRNA ligase Suhu pH pI Konsentrasi Enzim Konsentrasi Substrat Konsentrasi Pyrophosfat Application of Serine-tRNA ligase Sintesis SerylAdenylate Sintesis Diadenosine Tetraphosphate (Ap4A) Modification of Serine-tRNA ligase Proses aminoasilasi Sintesis Selenocystein