Download TRANSKRIPSI

Agustina Setiawati, M.Sc., Apt
REFERENSI/PUSTAKA


Albert, B., Bray, D., Lewis, J., Rarr, M., Roberts, K. and Watson,
J. O., 1994, Molecular Biology of The Cell, 3rd Ed., Garland
Publishing, Inc., New York.
Lodish, H., Arnold, B., Zipursky, S. L., Matsudara, P., David, B.
and Darnell, J. E., 2000, Molecular Cell Biology, W. H. Freeman
and Company, London.
STRUKTUR DNA
Double Helix
“Rungs of ladder”
Nitrogenous
Base (A,T,G or C)
“Legs of ladder”
Phosphate &
Sugar Backbone
UNIT FUNGSIONAL DNA/RNA
Perbedaan struktur gula antara
RNA dan DNA
BASA DNA

PURIN
1. Adenine (A)
2. Guanine (G)

A or G
PIRIMIDIN
3. Thymine (T)
4. Cytosine (C)
T or C
Chargaff’s Rule

Adenine berpasangan Thymine

Guanine berpasangan Cytosine
T
A
G
C
BASE-PAIRINGS
H-bonds
G
C
T
A
IKATAN RANTAI DNA
IKATAN FOSFODIESTER
RANTAI DNA BERSIFAT ANTIPARALEL
DNA vs. RNA

DNA

RNA

Double Helix
Gula deoksiribosa
Adenine berpasangan
Thymine (A-T)
Tetap ada di nukleus

Rantai tunggal
Gula ribosa
Adenin berpasangan
Uracil!
Ditransport ke
sitoplasma






Pendahuluan
DOGMA SENTRAL
TRANSKRIPSI

Proses sintesis RNA
(mRNA, t-RNA atau rRNA)
Table 14.2
Types of RNA
Type of RNA
Functions in
Messenger RNA
(mRNA)
Nucleus,
migrates
to ribosomes
in cytoplasm
Transfer RNA
(tRNA)
Cytoplasm
Provides linkage
between mRNA
and amino acids;
transfers amino
acids to ribosomes
Ribosomal RNA
(rRNA)
Cytoplasm
Structural
component
of ribosomes
Function
Carries DNA
sequence
information to
ribosomes
PRINSIP TRANSKRIPSI
TRANSKRIPSI = SINTESIS RNA (mRNA, tRNA, rRNA)






Prekursor : ATP CTP GTP UTP
Membutuhkan enzim RNA Polimerase
Urutan RNA ditentukan DNA
Salah satu untai DNA sebagai cetakan
Untai RNA tumbuh dengan arah 5’-3’
Polimerase mulai sintesis tanpa primer
Urutan basa RNA ditentukan oleh DNA
CCCTTTGGGAAA
DNA
GGGAAACCCUUU
Ikatan hidrogen
RNA
TB
RNA polymerase
gene,or
operon
DNA template
complementary RNA
TB
POLIMERASE RNA (465.000 kD)
core enzyme
'
holoenzyme
'
TB
Langkah pengabungan holo enzim


I
II

’
 
’ = core enzyme
CORE ENZYME
+
70
vegetative
(principal )
SIGMA SUBUNIT
Fungsi Sub Unit RNA Polimerase
I
II
· ' mengikat DNA template
·  mengikat perkusor RNA (ATP CTP GTP UTP)

’
·  penting untuk penggabungan sub unit dan aktivasi
enzim
70
·  mengenali sekuen promotor pada DNA
Promotor
Bagian DNA dimana RNA polimerase menempel untuk
memulai transkripsi
Daerah
up stream
Daerah yg
ditranskripsikan
Daerah
down stream
gene dsDNA
promoter
Transkripsi mulai
Daerah terminasi
TB
Tahap-tahap transkripsi
Inisiasi
2. Elongasi
3. Terminasi
1.
Transkripsi pd prokariot - INISIASI


Tdr atas 2 tahap :
 Holoenzim mengenal dan menempel pd promoter spesifik
 Terbentuk kompleks terbuka & proses inisiasi baru blgs.
Penempelan RNA polimerase pd promoter spesifik yaitu untai 10
nukleotida pd sisi 5’ (rantai -10, dikenal sbg Pribnow Box yg berisi
rantai TATAAT & rantai -35 adl TTGACA)
PREBEDAAN PROMOTER PROKARIOT &
EUKARIOT
Elongasi

Perpanjangan rantai RNA
PERPANJANGAN TRANSKRIPSI
TERMINASI TRANSKRIPSI
Terminator : Daerah pada DNA dapat menyebabkan
terjadinya terminasi (akhir transkripsi).
Terminasi DNA dibedakan menjadi 2, yaitu:
1. Terminasi Bebas
2. Terminasi tergantung Faktor
termination
RNA
UUUU
site
gene dsDNA
region where
terminators are
usually found
TB
TERMINASI bebas

Terbentuknya rantai RNA dengan bentuk hair pin (stem dan loop)
yang kaya akan G-C pada stem dan U pada loop.
RNA polymerase terikat
pada loop
TERMINASI tergantung faktor


Memerlukan protein rho (faktor ρ) dg BM 46000 & bfgs mbtk
heksamer yg menempel pd ss RNA sepanjang 72 pasangan basa
(setiap subunit protein ρ akan menempel pada 12 nukleotida)
Aktivitas ATPase protein ρ akan memungkinkan protein ρ bergerak
sepanjang hibrid DNA-RNA dg jalan menarik RNA menjauhi
kompleks transkripsi.
Monosistronik & polisistronik


Molekul mRNA eukariot tdr atas rangkaian2 nukleotida yg dpt
ditranslasi & tdk dapat ditranslasi. Polipeptida plg banyak hanya tdr
atas 500 asam amino yg dpt ditranslasi, dikenal sbg mRNA
monosistronik krn hanya mampu mbtk tdk lbh dr 1 mcm polipeptida.
Molekul mRNA prokariosit dpt mentranskripsi lebih dr 1 macam
polipeptida, dsbt mRNA polisistronik. Contoh : mRNA polisistronik E.
coli pbtk triptofan dg pjg 7000 rangkaian basa dpt mbtk 5 mcm
enzim.
Polisistronik
Monosistronik
Eukaryotic Transcription
Cytoplasm
DNA
Transcription
RNA
RNA
Processing
mRNA G
Nucleus
G
AAAAAA
Export
AAAAAA
Transkripsi Eukariotik
Butuh faktor transkripsi:
1.
Umum (TFIID, TFIIA,
TFIIB, TF IIE, TFIIH,
TFIIF)
2.
Spesifik:
Estrogen—sel payudara
A “Simple” Eukaryotic Gene
Transcription
Start Site
3’ Untranslated Region
5’ Untranslated Region
Introns
5’
Exon 1 Int. 1
Promoter/
Control Region
Exon 2
3’
Int. 2 Exon 3
Terminator
Sequence
Exons
RNA Transcript
5’
Exon 1 Int. 1
Exon 2
Int. 2 Exon 3
3’
mRNA maturasi pada Eukariot
5’ Untranslated Region
3’ Untranslated Region
Protein Coding Region
5’
5’ G
5’ Cap
Exon 1 Int. 1
Exon 2
3’
Int. 2 Exon 3
Exon 1 Exon 2 Exon 3
AAAAA
3’
3’ Poly A Tail
Setelah selesai disintesis, mRNA mengalami proses-proses sebagai
berikut :
1. Capping pada ujung 5’
2. Tailing pada ujung 3’
3.
Penghilangan Intron (Splicing)
mRNA Capping


Melindungi mRNA dari
degradasi eksonuklease 5’-3
Inisiasi transkripsi
Structure of the 5’ cap
7mG = 7-methyl guanosine
Triphosphate linkage
2’ ribose methylations
CPSF (cleavage/polyadenylation specificity factor)
AAAAAAA…..
SELESAI !!!!