Download Karakteristik utama, diversitas dan peran agro-fungsional

KELOMPOK 2







Rina Indriyani
Riya Sayekti
Rizky Rajabillah P.
Septiana Mega
Sofranita Syifa F.
Tri Dhika Utami
Tri Purwanti



Karakteristik Utama Bakteri
Diversitas Bakteri
Peran Agrofungsional






Prokariotik
Memiliki nukleoid, ribosom, mesosom,
sitoplasma
Memiliki dinding sel
Berukuran 0,5 – 5μm
Dinding sel terbentuk atas peptidoglikan
Motil (Flagel)



Dinding Sel : dari bahan peptidoglikan,
memberi perlindungan untuk mengatur
keluar masuknya zat-zat kimia, dinding sel
juga berperan dalam pembelahan sel
Lapisan Lendir(kapsul) : menyelubung
dinding sel, terdiri atas karbohidrat, memberi
perlindungan terhadap kekeringan
Membran sitoplasma :sebagai pelindung dan
mengatur transportasi sel.



Isi sel :Berupa protoplasma, bahan
terkandung yi karbohidrat, protein, enzimenzim juga belerang, kalsium karbonat dan
volutin yaitu suatu zat yang banyak
mengandung asam ribonukleat (ARN) yang
mudah menghisap warna tertentu yaitu zat
warna yang bersifat basa.
Ribosom : tempat sintesa protein
Mesosom : tempat terjadinya respirasi sel




Metabolic diversity
Morphological diversity
Genetic diversity
Structural diversity


bakteri autotrof (mmpu membuat mkanan
sndri dngan mmnfaatkan energi trtntu)
a. kemoautotrof : Thiosarcina rosea
b. fotoautotrof :-aerob ( Nitrosomonas)
-anaerob ( Clostridium tetani)
Bakteri heteretrof ( aktivitas mkannya
tergantung pada organisme atau renik)
a. Saprofit : Eschericia coli
b. parasit : Mycobacterium leprae
Nitrosomonas
Clostridium
tetani
Mycobacterium leprae

Bakteri Kokus : Bulat
a. Monokokus: kokus tunggal (Monococcus gonorhoe)
b. Diplokokus: dua sel bakteri kokus berdempetan
(Diplococcus pneumoniae)
c. Tetrakokus : empat sel bakteri kokus
berdempetan berbentuk segi empat.
(Pediococcus cerevisiae)
d. Sarkina: delapan sel bakteri kokus berdempetan
membentuk kubus (Thiosarcina rosea)
e. Streptokokus :lebih dari empat sel bakteri kokus
berdempetan membentuk rantai.
(streptococcus mutans)
f. Stapilokokus :lebih dari empat sel bakteri kokus
berdempetan seperti buah anggur
(Staphylococcus aureus)


Bakteri basil (batang)
a. Monobasil: basil tunggal(Eschericia coli)
b. Diplobasil : dua sel bakteri basil
berdmpetn(Salmonella typhosa)
c. Streptobasil :beberapa sel bakteri basil
berdmpetan membentuk rantai
(Azetobacter)
Bakteri spirillia (spiral)
a. Spiral : bentuk sel bergelombang
(Spirillum minor)
b. Spiroseta : bentuk sel seperti sekrup
(Treponema pallidum)
c. Vibrio : bentuk sel seperti tanda baca
koma (Vibrio comma)

Berdasarkan alat gerak
1. Monotrik : bila hanya berjumlah satu flagell
2. Lofotrik : bila banyak flagellum disatu sisi
3. Amfitrik : bila banyak flagellum dikedua
ujung
4. Peritrik : bila tersebar diseluruh permukaan
sel bakteri









Kingdom I: Proteobacteria
Kingdom II: Gram-Positive Bacteria
Kingdom III : Actinobacteria
Kingdom IV: Cyanobacteria,
Prochlorophytes, and
Chloroplasts
Kingdom V: Chlamydia
Kingdom VI: Planctomyces/Pirella
Kingdom VII : Verrumicrobia
Kingdom VIII: Bacteriodes/Flavobacteria
Kingdom IX : Cythopagha
 Kingdom X: Green Sulfur Bacteria
 Kingdom XI: Tightly Coiled Bacteria:
The Spirochetes
 Kingdom XII : Deinococci
 Kingdom XIII: The Green
Nonsulfur Bacteria
 Kingdom XIV : Thermotoga
 Kingdom XV : Thermodesulfobacterium
 Kingdom XVI : Aquifex, Thermocrinus
and relatives
 Kingdom XVII : Nitrospira
 Kingdom XVIII : Deferribacter
1.
2.
3.
4.
5.
6.
7.
8.
Purple Phototrophic Bacteria
The Nitrifying Bacteria
Sulfur and Iron Oxidizing
Bacteria
Hydrogen Oxidizing Bacteria
Methanotrophs and
Methylotrophs
Pseudomonas and The
Pseudomonads
Acetic Acid Bacteria
Free Living Aerobic Nitrogen
Fyxing Bacteria
9.
10.
11.
12.
13.
14.
15.
16.
17.
Neisseria, Chromobacterium,
and Relatives
Enteric bacteria
Vibrio and Photobacterium
Rickettsias
Spirilla
Sheathed Proteobacteria;
Sphaerotilus and Leptothrix
Budding and
Prosthecate/Stalked Bacteria
Gliding Myxobacteria
Sulfate-and Sulfur-Reducing
Proteobacteria
The Nitrifying Bacteria
Ciri:
Gram-negatif (1,5-4 x 4-40
µm), spiral, bulat telur,
berbentuk kacang, beberapa
batang motil melalui kutub
flagela, fototropik,anaerobik
yang menggunakan siklus
Calvin untuk fiksasi CO2, dan
memiliki bacteriochlorophylls
yang digunakan untuk
mereduksi molekul seperti
hidrogen sulfida, belerang,
tiosulfat atau hidrogen sebagai
sumber elektron untuk generasi
NADH dan NADPH
Halorhodospira, Thiocapsa





Ciri :
Gram-negatif (0,8-1 x 1-2 µm,
bulat (0,2-1 µm), spiral (0,3-0,4
µm diameter), lobular (1-1,5
µm); memiliki membran
kompleks luas dalam
sitoplasma
Lithotrophs aerobik yang
menggunakan karbon dioksida
atau karbonat sebagai sumber
karbon (melalui siklus Calvin)
dan memperoleh energi
dengan mengoksidasi
senyawa anorganik yang
mengandung nitrogen
berkurang (NH4 +, nitrit-)
Ditemukan di tanah, sistem
pengolahan limbah, air tawar,
dan habitat laut
Nitrobacter, Nitrosomonas
Ciri :
Gram-negatif (0,8-1 x 1-2 µm), coccoid
(0,2-1 µm), spiral (0,3-0,4 µm
diameter), lobular (1-1,5 µm); memiliki
membran kompleks luas dalam
sitoplasma; atau berserabut dengan
motilitas meluncur (Beggiatoa),
Lithotrophs aerobik menggunakan
karbon dioksida atau karbonat sebagai
sumber karbon (melalui siklus Calvin)
dan memperoleh energi dengan
mengoksidasi senyawa anorganik yang
mengandung sulfur tereduksi
(Thiobacillus, Thiomicrospora) dan
Ditemukan di tanah, sistem pengolahan
limbah, air tawar, dan habitat laut, mata
air terutama belerang
Hydrogen Oxidizing
Bacteria
Ciri :
Gram-negatif (0,8-1 x 1-2 µm), coccoid
(0,2-1 µm), spiral (0,3-0,4 µm diameter),
lobular (1-1,5 µm); memiliki membran
kompleks luas dalam sitoplasma;
Lithotrophs aerobik menggunakan
karbon dioksida atau karbonat sebagai
sumber karbon (melalui siklus Calvin)
(sama dengan SIOB) dan memperoleh
energi dengan mengoksidasi senyawa
anorganik yang mengandung hidrogen
tereduksi
Ditemukan di tanah, sistem pengolahan
limbah, air tawar, dan habitat laut, mata
air
Alcaligenes
Pseudomonas and The
Pseudomonads
Ciri :

motil ,Gram-negatif
(Methylmonas), nonmotile coccus
(Methylcoccus) atau vibrio motil
(Methylosinus); memiliki sterol
Aerobik organotrophs;
menghasilkan energi dengan
mengoksidasi metana (atau
kelompok metil)
# Luas di alam pada tanah

* Gram-negatif ,lurus atau sedikit
melengkung batang (0,5 x 1,5-1,4 x 6
µm); motil (flagela polar)
* Aerobik dan aerobik fakultatif
organotrophs; pernafasan (nonfermentasi) metabolisme yang
memanfaatkan jalur Entner-Doudoroff
,termasuk penggunaan nitrat sebagai
akseptor elektron akhir melalui
respirasi anaerob; rhizobia adalah
organisme aerobik yang hidup di
dalam organisme lain
* Hidup bebas untuk parasit pada
hewan (Pseudomonas) dan tanaman
(Pseudomonas, Xanthomonas);
ditemukan di dalam tanah dan air;
kadang-kadang hadir dalam infeksi
piogenik manusia dan hewan
Free Living Aerobic
Nitrogen Fyxing Bacteria
* Gram-negatif lurus atau
melengkung batang dan kokus
(0,3 x 2 sampai 0,9 x 20 µm);
motil - kutub (Gluconobacter)
atau peritrichous (Acetobacter)
flagela
* Organotrophs pernapasan
aerobik; memperoleh energi
dengan mengoksidasi etanol
menjadi asam asetat
* Hidup bebas, penting
dalam industri makanan
sebagai produsen cuka

* Gram-negatif, besar,
batang untuk berbentuk
buah pir (2-4 µm diameter)
* Aerobik ,mikroaerofilik
organotrophic nitrogen
pemecah masalah;
menggunakan asam amino
sebagai organik dan karbon
dan sumber energi, bukan
karbohidrat; Azotobacter
memiliki tingkat tercepat
oksigen-serapan dari
organisme yang dikenal
* Hidup bebas nitrogen
pemecah masalah terestrial,
termasuk Azospirillum,
Azotobacter, Azomonas
Neisseria,
Chromobacterium, and
Relatives
* Gram-negatif coccus (Neisseria) atau

batang-coccoid; umumnya nonmotile
(Moraxella dan Acinetobacter memiliki
berkedut motilitas); Chromobacterium
violaceum memiliki pigmen ungu terang
* Pernafasan aerobik (non-fermentasi)
organotrophs; oksidase positif; karbon
serbaguna dan sumber energi;
Chromobacterium fermentasi berbagai
karbohidrat dan menghasilkan pigmen
berwarna ungu (violacein) ketika tumbuh di
hadapan triptofan
* Diisolasi dari hewan (Neisseria umumnya
parasit, Branhamella beberapa simbiotik
dengan manusia) atau dari tanah dan air
(Acinetobacter); Chromobacterium dan

Acinetobacter kadang-kadang hadir dalam
infeksi piogenik manusia dan hewan
* Gram-negatif, lurus batang
(0,3-1 x 1-6 µm); nonmotile
untuk motil (flagela
peritrichous)
* Fakultatif aerob,
oksidase negatif; beragam
(termasuk fermentasi)
katabolisme organotrophic
* Yang normal flora dan /
atau parasit pada mamalia,
burung dan tanaman
Proteus, Enterobacter
Vibrio and
Photobacterium
*
* Gram-negatif, coccoid, pleomorfik (0,30,7 x 1-2 µm); nonmotile
Gram-negatif batang
* Aerobik organotrophs; Coxiella
melengkung (0,3-1 x 1-6 µm);
mengoksidasi glukosa; Rickettsia tidak
mengoksidasi glukosa atau asam
nonmotile untuk motil (flagela
organik, tetapi mendapatkan ATP dari
peritrichous atau kutub)
oksidasi glutamat atau glutamin, yang
* Fakultatif aerob, oksidase
mereka peroleh dari sel inang (ada
beberapa saran bahwa mereka juga
positif; beragam (fermentasi)
memperoleh NAD + dan koenzim A
katabolisme organotrophic
dari host sel), dan mereka bereplikasi
* Biasanya air (air tawar atau dalam sitoplasma sel inang sampai
dimuat dengan parasit
laut) yang hidup bebas; Vibrio
* Patogen - ditularkan kepada
cholerae dan parahemolyticus
manusia oleh arthropoda, Rickettsia
Vibrio bersifat parasit pada
adalah parasit intraseluler obligat;
Rochalimaea tumbuh melekat pada
hewan, terutama manusia;
membran luar sel inang sitoplasma
Photobacterium yang
bercahaya
Sheathed
Proteobacteria;
Sphaerotilus and
Leptothrix
* Gram-negatif; heliks untuk vibrioid
* Gram-negatif; berfilamen - rantai sel
(melengkung = heliks tetapi tidak
dikelilingi oleh struktur tubelike
cukup lama untuk mencakup satu
berongga (selubung) digunakan
putaran heliks penuh; 0,2 x 1,4-1,7 x
60 µm); motil melalui flagela (Spirillum, untuk lampiran permukaan (sering
memiliki holdfasts), adsorpsi nutrisi
Aquaspirillum) atau nonmotile
dan perlindungan dari predator;
(Spirosomaceae, Microcyclus)
elemen uniseluler (swarmers)
* Aerobik, fakultatif aerobik
umumnya motil dengan flagela
mikroaerofil atau organotrophs;
subkutub, beberapa nonmotile
menggunakan asam amino sebagai
(Crenothrix )
organik dan karbon / sumber energi,
* Oksidasi logam aerobik;
bukan karbohidrat
* Hidup bebas (air tawar - Spirillum, endapan besi atau mangan pada
Aquaspirillum; laut - Oceanospirillum), selubung; Lepthothrix mengoksidasi
mangan, Sphaerotilus tidak
tanah (beberapa nitrogen pemecah
* Air tawar (mengalir) habitat;
masalah - Azospirillum), parasit (hewan
- Campylobacter; bakteri - Bdellovibrio) sungai tercemar dan lumpur aktif
Budding and Prosthecate/
Stalked Bacteria
* Gram-negatif (0,5-1 x 1-3 µm);
mobile dengan flagela, kelompok
heterogen, namun berkembang
biak dengan tunas dan memiliki
prostheca (ekstrusi sitoplasma
seperti batang, hifa, atau
pelengkap lainnya); motil dengan
flagela ; Hyphomicrobium batang & tunas; Caulobacter tangkai dengan pegangan erat;
mereproduksi oleh tunas
* Umumnya aerobik
organotrophs (Rhodomicrobium
adalah sebuah phototrophic)
* Sering ditemukan dalam
miskin hara habitat air tawar
* Gram-negatif batang (0,6-0,9
x 3-8 µm) dengan motilitas
meluncur dan produksi tubuh
buah (50-500 µm tinggi) yang
berisi myxospores (Myxococcus,
Chondromyces)
* Organotrophs pernapasan
aerobik; micropredators yang
membunuh bakteri lain dengan
antibiotik, maka mensekresikan
enzim untuk membubarkan
mereka
* Ditemukan di seluruh
dunia dalam tanah, bahan
tanaman yang membusuk dan
kotoran hewan; yang paling
melimpah di daerah yang
hangat, juga ditemukan di
Arktik tundra
* Gram-negatif (meskipun beberapa Gram-positif
pembentuk Endospora); lurus, melengkung, atau
heliks batang (0,5-1,5 x 3-10 µm)
* Bakteri anaerob yang menggunakan sulfat atau
belerang sebagai akseptor elektron dalam respirasi
anaerob senyawa organik seperti asetat, yang
mereka mengoksidasi melalui jalur asetil-KoA,
ketika mereka memiliki sumber hidrogen dan
karbon dioksida, namun tidak ada senyawa organik,
mereka dapat menggunakan hydrogenase untuk
menghasilkan energi selama pertumbuhan
lithotrophic
* Berkembang dalam sedimen air tawar dan
digestors limbah; penting dalam siklus belerang;
memerangi hujan asam
Bakteri gram positif
dibagi menjadi dua
kelompok utama
subdivisi
phylogenetic, ‘low
GC’ dan ‘High GC’


Nonsporulating, Low GC, Gram-Positif Bacteria
ex : Staphylococcus, Micrococcus,Sarcina dan Lactic
Acid Bacteria
Endospore-Forming, Low GC, Gram-positif Bacteria
ex : Bacilllus, Paenibacillus, Sporolactobacillus,
Desulfotomaculum, Clostridium,
Thermoanaerobacter, Sporomusa, Sporohalobacter,
Anaerobacter, Alicyclobacillus, Amphibacillus ,
Heliobacterium, Heliophilum, Syntrophospora,
Desulfitobacterium , Sporosacrina

Cell Wall-Less, Low GC, Gram-Positive Bacteria: The
Mycoplasmas
Beberapa Mycoplasma memerlukan sterol dalam
media tumbuhnya dan sterol ini merupakan dasar
pembagian mycoplasma menjadi dua kelompok.
Requires sterols & Do not require sterols



High GC, Gram-positif Bacteria: Coryneform
and Propionic Acid Bacteria
High GC, Gram-positif Bacteria:
Mycobacterium
Filamentous, High GC, Gram-positif Bacteria:
The Actinomycetes

Termasuk kelompok
heterogeneous.
bersifat oxygenic
phototrophs.

berdasarkan morfologi :
uniseluler terbagi oleh
pembelahan biner;
uniseluler terbagi oleh
pembelahan multiple
(koloni); filamentous
terdiri dari sel yang
membedakan disebut
heterocysts yang
berfungsi pada fiksasi
nitrogen; filamentous
bentuk non-heterocysts;
dan tipe filamentous
bercabang.
bakteri parasit obligate dengan kemampuan
metabolism rendah, Tiga spesies Chlamydia
yang diketahui : C. psittaci, penyebab
penyakit psittacosis; C. trachomatis,
penyebab trachoma dan berbagai macam
penyakit manusia lainnya; C. pneumoniae,
penyebab berbagai macam syndrome
pernafasan.
terdiri dari sejumlah
morfologi unik bacteri
termasuk genera
Planctomyces, Pirella,
Gemmata, dan Isosphaera.
merupakan bakteri
bertangkai, Tangkai
Planctomyces kiranya
berfungsi sebagai alat
pelengkap.
,kekurangan peptidoglikan
dan dinding selnya
merupakan tipe lapisan S
(S-layer type) terbuat dari
protein mengandung
cystein (sebagai cystein)
dan proline. Sebagai
organism yang kekurangan
peptidoglikan organism ini
resisten terhadap antibiotic
seperti penisilin dan
cephalosporin, obat yang
mengacaukan sintesisi
peptidoglikan.




Gram-negative dengan
peptidoglycan dan
bberapa prosthecae
Bersifat aerobik
fakultatif
Ditemukan di air dan
tanah
Verrucomicrobium,
Prosthecobacter
obligate anaerob,
memfermentasi gula
terutama asetat dan
suksinat sebagai hasil
fermentasi. bersifat
komensalisme,
ditemukan pada jalan
usus manusia dan
hewan.

Cytophaga
berbentuk panjang,
tipis, bergerak
dengan meluncur.
Kerabat genus,

Sporocytophaga
sama dengan
Cytophaga baik
secara morfologi
maupun fisiologi.
mereka tersebar
luas didalam tanah
dan air.
terdiri dari anaerobic obligate
dan spesies phototrophic
diantara biakan isolasi.
Kelompok ini secara morfologi
bermacam-macam dan
termasuk batang yang pendek
dan panjang. Seperti purple
sulfur bacteria mereka
menggunakan H2S sebagai
donor electron, mengoksidasi
pertama menjadi S0 dan
selanjutnya menjadi SO42-.
Tetapi, tak seperti purple
sulfur bacteria, sulfur ini
dihasilkan oleh green sulfur
bacteria yang bertempat
tinggal di luar sel.
Bacteriochlorophylls
ditemukan di green sulfur
bacteria termasuk
Bacteriochlorophylls a dan
juga Bacteriochlorophylls c,
d atau e. pigmen yang
terakhir hanya berfungsi
pada reaksi lightharvesting dan berlokasi
pada truktur yang unik
yang disebut chlorosome.
Chlorosome merupakan
busur kaya
Bacteriochlorophylls yang
membatasi badan dengan
tipis.
Spirochetes merupakan gram negative,
motile, bakteri dengan gulungan rapat
(Tightly Coiled Bacteria), dan berstruktur tipis
lembut. Sel Spirochetes dibuat dari silinder
protoplasma (protoplasmic cylinder)
memadat di bagian yang tertutup anatara
dinding sel dan membrane.
Endoflagella dan silinder protoplasma
dikelilingi oleh multilapisan seperti
membrane fleksibel yang disebut outer
sheath (sarung terluar).
terdiri tiga genera, adalah Deinococcus dan Thermus.
Genus yang terakhir berisi thermophilic
chemoorganotrophic bacteria ternasuk Thermos
aquaticus.
Genus Deinococcus terdiri dari empat spesies cocci grampositif, D. radiodurans merupakan bakteri gram-negatif.
D. radiodurans bersifat aerob chemoorganotroph,
biasanya tumbuh pada media yang kompleks.
Kebanyakan Deinococci berwarna merah atau pink, warna
itu dikarenakan berbagai macam karotenoid ditemukan
pada organism ini, dan beberapa strains sangat tahan
terhadap radiasi ultraviolet dan kekeringan. Deinococci
radiodurans tahan terhadap radiasi ultraviolet. Selain itu
Deinococci radiodurans tahan terhadap efek mutagen dari
banyak agent mutagenic lainnya.
bersifat nyata berbeda dan hanya terdiri dari beberapa genera, yang
diketahui adalah anoxyphototrop Chloroflexus, yang seluruhnya
bersifat thermophilic. Thermomicrobium merupakan anggota
chemotropic dari kelompok ini dan sangat aerob, silinder gramnegatif, tumbuh secara optimal pada komplek media dengan suhu
75oC. Selain itu Thermomicrobium memiliki membrane lipid. Lipid
Thermomicrobium mengandung 1,2-dialcohols sebagai pengganti
gliserol, dan tidak mempunyai garis keturunan ester dan ether.
Chloroflexus mengandung bacteriochlorophyll c dan clorosome.
Meskipun bacteriochlorophyll a terdapat pada membrane plasma sel
Chloroflexus tersususn menjadi bentuk pusat reaksi photosisntesis
secara structural dikenali sebagai purple bacteria.
Selain Chloroflexus, phototrophic green nonsulfur bacteria termasuk
thermophile Heliothrix dan sel besar mesophile Oscillochloris. Secara
phylogenetik dan kenampakan Heliothrix sangat mirip Chloroflexus
kecuali bahwa kekurangannya bacteriochlorophyll c dan chlorosome
pada organism ini.
Thermogota berbentuk silinder (batang), hidup
mencapai suhu 90oC (optimum, 80oC). sel
thermogota berisi sarung seperti amplop, stain
gram-negatif dan nonsporing, anaerob,
fermentative chemoorganotroph, mengurai gula
dan beberapa polimer seperti zat tepung, dan
memproduksi laktat, asetat, CO2, dan H2 sebagai
hasil fermentasi.


Thermodesulfobacterium bersifat
thermophilic, pereduksi sulfat,
thermophilic, Thermodesulfobacterium
menggunakan senyawa seperti laktat,
pirufat dan etanol, mereduksi SO42- menjadi
H2S.
Hidup diatas 80oC.

Aquifex
Gram-negatif hyperthermophilic (suhu
optimum untuk pertumbuhan adalah 85C,
tetapi dapat tumbuh hingga 95C ... paling
termofilik dari semua bakteri yang dikenal)
mikroaerofilik (salah satu dari beberapa
aerobik hyperthermophiles dikenal)

Thermocrinus
merah muda membentuk filamenhyperthermophilic (suhu optimum untuk
pertumbuhan adalah 80C) bakteri terisolasi di
Taman Nasional Yellowstone (salah satu dari
prokariota pertama kali diisolasi oleh Thomas
Brock pada tahun 1960)
lithotrophic bacillus yang mengoksidasi
hidrogen, tiosulfat atau O2 menggunakan
belerang sebagai terminal akseptor elektron




Gram-negatif, pengoksidasi aerobik (NO2NO3-)
Contoh Nitrospira
Gram-negatif, anaerob,
Contoh : Flexistipes

Click this

Kingdom I
1. Nitrobacter, Nitrosomonas (membantu
ketersediaan nitrat bagi tanaman)
2. Beggiatoa (Beggiatoa yang mampu
mengoksidasi sifat toksik dari H2S pada
akar tanaman)
3. Alcaligenes sp (bermanfaat untuk
pembuatan susu)
4. Acetobacter (bermanfaat untuk
pembuatan cuka)
5. Azotobacter, Azomonas (Fiksasi
nitrogenbagi tanaman)
6. Escherichia C. (Pembusukan makanan)
Kingdom 2
Lactobacillus (pembuatan yoghurt)
Kingdom 3
Streptomyces griceus (pembuatan obat)
Kingdom 4
Nostoc (Berperan dalam fiksasi nitrogen)
Kingdom 8
Flavobacterium (penambat nitrogen)
Kingdom 9
Cytophaga (Pembuatan pupuk organik)
Kingdom 10
Chlorobium (penambat nitrogen)
Kingdom 17
Nitrospira (bakteri nitrifikasi)