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CURRICULUM VITAE DELL’ATTIVITA’ SCIENTIFICA E DIDATTICA REDATTO AI SENSI DEGLI ARTT. 46 E 47 DEL D.P.R. 28.12.2000, N. 445 (DICHIARAZIONI SOSTITUTIVE DI CERTIFICAZIONI E DELL’ATTO DI NOTORIETA’) LA SOTTOSCRITTA Cognome Bruno Nome Giulia e residente in Torino Nata a Torino via ( le candidate indichino il cognome da nubile) (Prov TO ) il 17/02/1982 Tofane 44 E e ai sensi degli artt. 46 e 47 del D.P.R. 445/2000 e consapevole che le dichiarazioni mendaci sono punite ai sensi del codice penale e delle leggi speciali in materia, secondo le disposizioni richiamate dall'art. 76 del D.P.R. 445/2000 DICHIARA: che quanto contenuto nel presente curriculum corrisponde a verità. Occupazione attuale Da Marzo 2009. Titolare di un assegno di ricerca presso il Politecnico di Torino. Istruzione Gennaio 2006-Dicembre 2008. Dottorato di ricerca in Ingegneria Informatica e dei Sistemi presso il Politecnico di Torino. Tutore: prof.ssa Elena Baralis. Titolo tesi: “Extraction of association rules from biological data”. Settembre 2003-Settembre 2005. Corso di laurea specialistica in Ingegneria Informatica presso il Politecnico di Torino con voto di laurea 110 e lode. Titolo tesi: “Individuazione di situazioni di rischio in dati clinici rilevati da sensori”. Settembre 2000-Settembre 2003. Corso di laurea triennale in Ingegneria Informatica presso il Politecnico di Torino con voto di laurea 110 e lode. Settembre 2000. Diploma di Maturità presso il liceo scientifico statale Galileo Ferraris di Torino con votazione 100/100. Lingue straniere Inglese (livello avanzato): First Certificate in English, IELTS voto 7 Francese (livello base) Premi e borse di studio Giulia Bruno è risultata vincitrice della selezione pubblica per l’attribuzione di un assegno di ricerca finalizzato a sostenere l’attività di studio e ricerca scientifica presso il Dipartimento di Automatica e Informatica del Politecnico di Torino dall’1/03/2009 al 28/02/2010. Giulia Bruno è risultata vincitrice di una borsa di studio di durata triennale (Gennaio 2006 Dicembre 2008) per svolgere il Dottorato di ricerca in Ingegneria Informatica e dei Sistemi presso il Politecnico di Torino. Partecipazione a conferenze internazionali Giulia Bruno ha partecipato in qualita di relatore alle seguenti conferenze internazionali: IEEE International Conference on Intelligent Systems, 4-6 September 2006, London, UK. International Integrative Bioinformatics Workshop, 4-6 September 2006, Harpenden, UK. IEEE International Workshop on Flexible Database and Information Systems Technology, 3-7 September 2007, Regensburg, Germany. Attività scientifica L’attività di ricerca è stata svolta principalmente nei settori del data mining e della bioinformatica, in particolare sui seguenti argomenti. Selezione dei geni più’ rilevanti nell’identificazione dei tumori attraverso l’analisi di dati da microarray. I microarray, o matrici ad alta densità, permettono di analizzare i profili di espressione genica di un intero organismo, misurando il valore di espressione di decine di migliaia di geni contemporaneamente. La disponibilità di una così grande quantità di dati richiede la creazione e l’implementazione di metodi adatti a gestirli. Nell’attività di ricerca è stata proposta una nuova tecnica per selezionare i geni più rilevanti al fine di caratterizzare particolari tipi di malattie tumorali, come descritto nell’articolo pubblicato a conferenza [13]. Inoltre è stato svolto uno studio sulla cardinalità minima dei geni da selezionare in modo da raggiungere la più alta accuratezza in fase di classificazione, come descritto in [11]. Estrazione di regole di associazione temporali da dati di microarray. Nell’attività di ricerca si è estesa la tecnica di estrazione di regole di associazione al dominio temporale, per tenere conto del ritardo che intercorre tra i meccanismi regolativi tra i geni, causati dalla loro diversa concentrazione di RNA nelle cellule. La tecnica è stata applicata a basi di dati di espressione genetica (microarray) temporali, per ricavare relazioni di attivazione e inibizione tra geni nel tempo, come descritto nell’articolo pubblicato a conferenza [10]. Si è inoltre svolta un’analisi si diverse tecniche di discretizzazione dei dati e dell’opportuna introduzione di un indice di qualità per la valutazione delle regole estratte. Ricerca di anomalie nelle basi di dati. La grande quantità di dati oggi disponibili richiede un’attenta analisi e gestione, per ricavare informazione utile e individuare la presenza di errori. Nell’attività di ricerca è stato proposto l’uso delle regole di associazione e delle quasi-dipendenze funzionali per l’identificazione di anomalie ed errori all’interno delle basi di dati. In particolare le tecniche di ricerca di anomalie sono state applicate a database contenenti informazioni sulla classificazione delle proteine, come descritto in [3]. Le stesse tecniche possono essere utilizzate per esplicitare i vincoli presenti nelle basi di dati biologiche, come descritto in [6]. L’applicazione delle quasi-dipedenze funzionali si è rivelata utile anche nell’analisi dei documenti XML. Il risultato è confluito in un articolo pubblicato su rivista internazionale [2], un articolo pubblicato a workshop [12], e uno a conferenza nazionale [16]. Una versione incrementale dell’algoritmo, per aggiornare le anomalie senza estrarre nuovamente le regole è stata presentata nel capitolo di libro [7]. Analisi di segnali fisiologici per l’individuazione di situazioni di rischio. L’attività di ricerca è rivolta all’analisi di segnali fisiologici (es., battito cardiaco, pressione arteriosa, saturazione periferica di ossigeno nel sangue) per monitorare le condizioni di salute dei pazienti e individuare in modo automatico eventuali situazioni di rischio. Nella pubblicazione a conferenza [15] è stato proposto un framework per la creazione di modelli personalizzati per paziente e/o patologia, identificando le situazioni anomale o rischiose attraverso opportune tecniche di clustering. Una versione estesa del lavoro è stata pubblicata su capitolo di libro [8]. Nell’articolo [14] è stato presentato un’ulteriore sviluppo dell’analisi di dati fisiologici ad intervalli temporali estesi, che supera l’analisi istantanea svolta nel precedente lavoro, mentre una panoramica delle architetture di rilevamento, analisi e trasmissione dati per il tele-monitoraggio a distanza dei pazienti, contenente anche il framework proposto, è stata pubblicata su un capitolo di libro [9]. Una versione ulteriormente estesa contenente la formulazione teorica dell’analisi del rischio e nuove sessioni sperimentali è stata pubblicata su transaction [1]. Collaborazioni scientifiche esterne Giulia Bruno ha collaborato per svolgere attività scientifiche con la dott.ssa Elisa Quintarelli del Politecnico di Milano. Le collaborazioni sono confluite nelle pubblicazioni dei risultati ottenuti [2, 7, 12, 16]. Collaborazioni informali sono state anche effettuate con la dott.ssa Giovanna Chiorino del Fondo Edo Tempia di Biella e con la dott.ssa Elisa Berno dell’Ospedale Gradenigo di Torino per il supporto all’analisi di dati biologici. Attività didattica Giulia Bruno ha ricoperto il ruolo di esercitatore e ha curato la preparazione di materiale didattico relativo alle esercitazioni in aula e/o di laboratorio per i seguenti corsi: Anno accademico 2009-2010 o Basi di dati, III anno del Corso di Laurea di primo livello in Ingegneria Informatica, III Facoltà di Ingegneria - prof.ssa Silvia Chiusano. o Basi di dati, II anno del Corso di Laurea di primo livello in Ingegneria del Cinema e dei Mezzi di Comunicazione, III Facoltà di Ingegneria - prof.ssa Laura Farinetti. Anno accademico 2008-2009 o Basi di dati, II anno del Corso di Laurea di primo livello in Ingegneria del Cinema e dei Mezzi di Comunicazione, III Facoltà di Ingegneria - prof.ssa Laura Farinetti. o Tecniche e linguaggi di programmazione, I anno del Corso di Laurea di primo livello in Ingegneria del Cinema e dei Mezzi di Comunicazione, III Facoltà di Ingegneria prof. Juan Carlos de Martin. Anno accademico 2007-2008 o Basi di dati, II anno del Corso di Laurea di primo livello in Ingegneria del Cinema e dei Mezzi di Comunicazione, III Facoltà di Ingegneria - prof.ssa Laura Farinetti. o Sistemi Informativi Aziendali, II anno del Corso di Laurea Specialistica in Ingegneria dell’Autoveicolo, I Facoltà di Ingegneria - prof.ssa Laura Farinetti Anno accademico 2006-2007 o Sistemi Informativi Aziendali, II anno del Corso di Laurea Specialistica in Ingegneria dell’Autoveicolo, I Facoltà di Ingegneria - prof.ssa Laura Farinetti. Anno accademico 2005-2006 o Sistemi Informativi Aziendali, II anno del Corso di Laurea Specialistica in Ingegneria dell’Autoveicolo, I Facoltà di Ingegneria - prof.ssa Laura Farinetti. Elenco completo delle pubblicazioni Riviste internazionali [1] D. Apiletti, E. Baralis, G. Bruno, T. Cerquitelli (2009). Real-time analysis of physiological data to support medical applications. IEEE Transactions on Information Technology in Biomedicine, Vol.13, pp.313-321, ISSN:1089-7771. [2] G. Bruno, P. Garza, E. Quintarelli, R. Rossato (2007). Anomaly detection through quasi-functional dependency analysis. Journal of Digital Information Management, Vol. 5(4), pp.191-200, ISSN:0972-7272. [3] D. Apiletti, E. Baralis, G. Bruno, E. Ficarra (2006). Data Cleaning and Semantic Improvement in Biological Databases. Journal of Integrative Bioinformatics, Vol. 3 (2), ISSN:1613-4516. Capitoli di libro [4] G. Bruno, A. Fiori (in stampa). Microarray data mining: issues and prospects. Knowledge Discovery Practices and Emerging Applications of Data Mining: Trends and New Domains. IGI Global. [5] D. Apiletti, E. Baralis, G. Bruno, T. Cerquitelli, A. Fiori (2009). Real-time and Mobile Physiological Data Analysis. Information Discovery on Electronic Health Records. Chapman & Hall/CRC, ISBN:978-1420090383. [6] D. Apiletti, E. Baralis, G. Bruno, E. Ficarra (2009). Extraction of Constraints from Biological Data. Biomedical Data and Applications. Springer, Vol.224, pp.169-186, ISBN:978-3-642-02192-3. [7] G. Bruno, P. Garza, E. Quintarelli (2009). Mining rare association rules by discovering quasi-functional dependencies: an incremental approach. Rare Association Rule Mining and Knowledge Discovery: Technologies for Infrequent and Critical Event Detection. Information Science Reference (IGI Global), pp.131-149, ISBN:978-1-60566-754-6. [8] D. Apiletti, E. Baralis, G. Bruno, T. Cerquitelli (2008). Real-time Individuation of Global Unsafe ANomalies and Alarm activation. Intelligent Techniques and Tools for Novel System Architectures. Springer, Vol.109, pp.219-236, ISBN:978-3-540-77621-5. [9] D. Apiletti, E. Baralis, G. Bruno, T. Cerquitelli (2008). Ubiquitous risk analysis of physiological data. Handbook of Research on Distributed Medical Informatics & E-Health. IGI Global, pp.478-492, ISBN:978-1-60566-002-8. Conferenze internazionali [10] E. Baralis, G. Bruno, E. Ficarra (2008). Temporal Association Rules for Gene Regulatory Networks. IEEE International Conference on Intelligent Systems, Varna, Bulgaria, September 3-7, 2008, ISBN: 978-1-4244-1739-1. [11] E. Baralis, G. Bruno, A. Fiori (2008). Minimum Number of Genes for Microarray Feature selection. International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society, Vancouver, British Columbia, Canada, August 20-24, 2008, pp.5692-5695, ISBN:978-1-4244-1815-2. [12] G. Bruno, P. Garza, E. Quintarelli, R. Rossato (2007). Anomaly detection in XML databases by means of association rules. IEEE International Workshop on Flexible Database and Information Systems Technology, Regensburg, Germany, September 3-7, 2007, pp.387-391, ISBN:978-0-7695-2932-5. [13] D. Apiletti, E. Baralis, G. Bruno, A. Fiori (2007). The Painter's Feature Selection for Gene Expression Data. International Conference of the IEEE Engineering in Medicine and Biology Society, Lyon, France, August 23-26, 2007, pp.4227-4230, ISBN:1-4244-0788-5. [14] D. Apiletti, E. Baralis, G. Bruno, T. Cerquitelli (2007). SAPhyRA: Stream Analysis for Physiological Risk Assessment. IEEE International Symposium on Computer- Based Medical Systems, Maribor, Slovenia, June 20-22, 2007, pp.193-198, ISBN: 0-7695-2905-4. [15] D. Apiletti, E. Baralis, G. Bruno, T. Cerquitelli (2006). IGUANA: Individuation of Global Unsafe ANomalies and Alarm activation. IEEE International Conference on Intelligent Systems, London, UK, September 4-6, 2006, pp.267-272, ISBN: 1-4244-0196-8. Conferenze nazionali [16] G. Bruno, P. Garza, E. Quintarelli, R. Rossato (2007). RADAR: Research of Anomalous Data through Association Rules (Extended Abstract), SEBD-07, Fasano, Italy, June 17-20, pp.290-297, ISBN: 978-88-902981-0-3. Giulia Bruno