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Lebenslauf
Dr. Christina Ludwig
Person
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Christina Ludwig
3. Juni 1980 in Lich
Deutsch
Leiterin der Abteilung Proteomik am Bayrischen Zentrum für
Biomolekulare Massenspektrometrie
Technische Universität München,
Bayrisches Zentrum für Biomolekulare Massenspektrometrie
Gregor-Mendel-Strasse 4, 85354 Freising
08161 716130
[email protected]
Wissenschaftlicher Werdegang
1999 – 2004:
2002 – 2003:
2004 – 2008:
2009 – 2015:
2015 – heute:
Chemiestudium an der Philipps-Universität Marburg
(Deutschland). Diplomarbeit in der Arbeitsgruppe von
Professor Mohamed A. Marahiel (Fachbereich Biochemie):
“Expressed protein ligation of multi-domain proteins for
segmental isotopic labelling”
Freiwilliges Forschungssemester an der Universität Sydney
(Australien) in der Arbeitsgruppe von Professor Peter Lay
(Fachbereich Anorganische Chemie): “The genotoxicity of
Chromium(V)-complexes”
Doktorarbeit an der Technischen Universität Dortmund
(Deutschland) in der Arbeitsgruppe von Professor Henning
Mootz (Fachbereich Chemische Biologie): “Protein semisynthesis and mechanistic studies on protein splicing using a
split intein”
Postdoktorandin an der Eidgenössischen Technischen
Hochschule Zürich (Schweiz) in der Arbeitsgruppe von
Professor Rudolph Aebersold (Institut für Molekulare
Systembiologie)
Leitung der Abteilung Proteomik am bayrischen Zentrum für
Biomolekulare Massenspekrometrie
Stipendien und Auszeichnungen
07/2014:
„Young investigator award“ verliehen bei der Konferenz
„Mikromethoden in der Proteinchemie” in Dortmund
12/2009:
Auszeichnung der Doktorarbeit mit “summa cum laude”
05/2005 - 04/2007: Stipendiatin der “Fonds der Chemischen Industrie”
06/1999:
Auszeichung als herausragende Abiturientin der Liebigschule
Giessen (Abschlussnote 1.0)
Publikationen
•
Schubert O.T., Ludwig C*., Kogadeeva M., Zimmermann M., Rosenberger G.,
Gengenbacher M., Gillet L.C., Collins B.C., Röst H.L., Kaufmann S.H., Sauer U.,
Aebersold R. (2015) Absolute Proteome Composition and Dynamics during Dormancy
and Resuscitation of Mycobacterium tuberculosis, Cell Host and Microbe, 18, 96-108.
Pubmed link: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/26094805
•
Oliveira A.P., Ludwig C*., Zampieri M., Weisser H., Aebersold R., Sauer U. (2015),
Dynamic phosphoproteomics reveals TORC1-dependent regulation of yeast
nucleotide and amino acid biosynthesis, Science Signaling, 8, 374. Pubmed link:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25921291
•
Oliveira A.P., Dimopoulos S., Busetto A.G., Christen S., Dechant R., Falter L., Haghir
Chehreghani M., Jozefczuk S., Ludwig C., Rudroff F., Schulz J.C., González A., Soulard
A., Stracka D., Aebersold R., Buhmann J.M., Hall M.N., Peter M., Sauer U., Stelling J.
(2015) Inferring causal metabolic signals that regulate the dynamic TORC1dependent transcriptome, Molecular Systems Biology, 11, 802. Pubmed link:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/25888284
•
Rosenberger, G., Ludwig, C., Röst, H. L., Aebersold, R., and Malmström, L. (2014)
aLFQ: An R-package for estimating absolute protein quantities from label-free LCMS/MS proteomics data, Bioinformatics, btu200. Pubmed link:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/24753486
•
Ludwig, C. and Aebersold, R. (2014) Getting Absolute: Determining Absolute Protein
Quantities via Selected Reaction Monitoring Mass Spectrometry, Quantitative
Proteomics (Royal Society of Chemistry), editors R. Eyers, C. E., and Gaskell, S.J.
http://pubs.rsc.org/en/content/chapterpdf/2014/9781782626985-00080?isbn=9781-84973-808-8&sercode=bk
•
Gerster, S., Kwon, T., Ludwig, C., Matondo, M., Vogel, C., Marcotte, E. M., Aebersold,
R., and Bühlmann, P. (2014) Statistical approach to protein quantification, Molecular
and Cellular Proteomics, 13, 666–677. Pubmed link:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/24255132
•
Sunnåker, M., Zamora-Sillero, E., Dechant, R., Ludwig, C., Busetto, A. G., Wagner, A.,
and Stelling, J. (2013) Automatic generation of predictive dynamic models reveals
nuclear phosphorylation as the key Msn2 control mechanism, Science Signaling, 6,
ra41–ra41. Pubmed link: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23716718
•
Schubert, O. T., Mouritsen, J., Ludwig, C., Röst, H. L., Rosenberger, G., Arthur, P. K.,
Claassen, M., Campbell, D. S., Sun, Z., Farrah, T., Gengenbacher, M., Maiolica, A.,
Kaufmann, S. H. E., Moritz, R. L., and Aebersold, R. (2013) The Mtb proteome library:
a resource of assays to quantify the complete proteome of Mycobacterium
tuberculosis, Cell Host and Microbe, 13, 602–612. Pubmed link:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23684311
•
Wasmuth, A., Ludwig, C., and Mootz, H. D. (2013) Structure-activity studies on the
upstream splice junction of a semisynthetic intein, Bioorganic and Medicinal
Chemistry, 21, 3495–3503. Pubmed link:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23618706
•
Oliveira, A. P., Ludwig, C*., Picotti, P., Kogadeeva, M., Aebersold, R., and Sauer, U.
(2012) Regulation of yeast central metabolism by enzyme phosphorylation,
Molecular Systems Biologie, 8, 623. Pubmed link:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23149688
•
Glatter, T., Ludwig, C., Ahrné, E., Aebersold, R., Heck, A. J. R., and Schmidt, A. (2012)
Large-scale quantitative assessment of different in-solution protein digestion
protocols reveals superior cleavage efficiency of tandem Lys-C/trypsin proteolysis
over trypsin digestion, Journal of Proteome Research, 11, 5145–5156. Pubmed link:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/23017020
•
Schwarzer, D., Ludwig, C*., Thiel, I. V., and Mootz, H. D. (2012) Probing inteincatalyzed thioester formation by unnatural amino acid substitutions in the active site,
Biochemistry, 51, 233–242. Pubmed link:
http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22182201
•
Ludwig, C., Claassen, M., Schmidt, A., and Aebersold, R. (2012) Estimation of
absolute protein quantities of unlabeled samples by selected reaction monitoring
mass spectrometry, Molecular and Cellular Proteomics, 11, M111.013987–
M111.013987. Pubmed link: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/22101334
•
Ludwig, C., Schwarzer, D., Zettler, J., Garbe, D., Janning, P., Czeslik, C., and Mootz, H.
D. (2009) Semisynthesis of proteins using split inteins, Methods in Enzymology, 462,
77–96. Pubmed link: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/19632470
•
Ludwig, C., Schwarzer, D., and Mootz, H. D. (2008) Interaction studies and alanine
scanning analysis of a semi-synthetic split intein reveal thiazoline ring formation from
an intermediate of the protein splicing reaction, Journal of Biological Chemistry, 283,
25264–25272. Pubmed link: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/18625708
•
Ludwig, C., Pfeiff, M., Linne, U., and Mootz, H. D. (2006) Ligation of a synthetic
peptide to the N terminus of a recombinant protein using semisynthetic protein
trans-splicing, Angewandte Chemie International Edition, 45, 5218–5221. Pubmed
link: http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/16823791
* gleichermassen beitragender Erstautor
Zitationslist in Google Scholar:
http://scholar.google.ch/citations?hl=de&user=eC9hVGcAAAAJ
Präsentationen bei Wissenschaftlichen Konferenzen
04/2015:
03/2015:
12/2014:
07/2014:
03/2014:
10/2012:
05/2012:
05/2012:
03/2012:
06/2011:
03/2011:
06/2010:
10/2010:
10/2008:
10/2007:
11/2006:
09/2005:
6. Berlin LC/MS/MS Symposium, Berlin, Deutschland (eingeladene
Sprecherin)
Proteomic Forum – Educational Day, Berlin, Deutschland (eingeladene
Sprecherin)
6. Konferenz “Proteomics from Discovery to Function”, Mumbai,
Indien (eingeladene Sprecherin)
Konferenz “Mikromethoden in der Proteinchemie”, Dortmund,
Deutschland (Sprecherin)
“Nordic Proteomic Conference”, Turku, Finnland (eingeladene
Sprecherin)
Boehringer Ingelheim Meeting "Protein Quantification by LC-MS",
Biberach, Deutschland (eingeladene Sprecherin)
“60th ASMS conference on Mass Spectrometry and Allied Topics”,
Vancouver, Kanada (Sprecherin)
Skyline User Meeting bei der “60th ASMS Conference on Mass
Spectrometry and Allied Topics”, Vancouver, Kanada (eingeladene
Sprecherin)
ProteoMMX 2.0 Symposium “Strictly Quantitative”, Chester, England
(eingeladene Sprecherin)
“59th ASMS Conference on Mass Spectrometry and Allied Topics”,
Denver, USA (Poster)
Research group meeting “Unicellsys”, Punta Negra, Mallorca
(eingeladene Sprecherin)
D-BIOL Symposium ETH Zürich, Davos, Schweiz (Poster)
“Meeting of the Netherlands Proteomics Platform”, Utrecht,
Niederlande (eingeladene Sprecherin)
EMBL Konferenz “Chemical Biology”, Heidelberg, Deutschland
(Poster)
“Chemical Protein Synthesis Meeting”, Heron Island, Australien
(Sprecherin)
Konferenz “ChemBionics: Prospects of biohybrid molecules”,
Rauischholzhausen, Deutschland (Poster)
“14th Symposium on Bioorganic Chemistry”, Aachen, Deutschland
(Sprecherin)
Lehre und Organisation von Proteomik Kursen und Workshops
05/2015:
Internationaler Kurs “Mass spectrometry-based proteomics:
computation and statistics for discovery and targeted analysis”,
Northeastern University Boston, USA, http://olga-vitek-lab.org/neu-
12/2014:
10/2014:
08/2014:
08/2014:
05/2014:
03/2014:
07/2013:
& 02/2014
& 06/2015
11/2013:
09/2013:
08/2013:
06/2012:
11/2010:
short-course/ (eingeladene Sprecherin)
Internationaler Kurs “Targeted Proteomics” im Rahmen der Konferenz
“Proteomics from Discovery to Function”, Mumbai, Indien,
http://www.bio.iitb.ac.in/~sanjeeva/psi2014/?page_id=54
(eingeladene Sprecherin)
EMBO Kurs “Targeted Proteomics”, Barcelona, Spanien,
http://events.embo.org/14-targeted-proteomics/index.html
(eingeladene Sprecherin)
Internationaler Workshop “Targeted Proteomics” im Rahmen der
“International Mass Spectrometry conference“ (IMSC), Genf, Schweiz,
http://www.imsc2014.ch/?page_id=496 (Organisatorin)
“8th European summer school on advanced proteomics”, Brixen,
Italien, http://www.proteomic-basics.eu (eingeladene Sprecherin)
“Advanced education series Genetics 2014" der schweizer
Versicherungsgesellschaft, Olten, Schweiz (eingeladene Sprecherin)
Internationaler SRM-Workshop im Rahmen der “Nordic proteomic
conference”, Turku, Finnland, http://nordicproteomics2014.org
(Organisatorin)
Internationaler Kurs “Targeted Proteomics”, Zürich, Schweiz,
http://targetedproteomics.ethz.ch
(Organisatorin)
EuPA Kurs “Bioinformatics for proteomics”, Zürich, Schweiz,
http://proteomics.ethz.ch/eupa_bioinf_2013/program.html
(eingeladene Sprecherin)
Öffentliche Vortragsserie der ETH Zürich “Personalized Medicine”,
Zürich, Schweiz, http://www.uzh.ch/news/articles/2013/daspersoenliche-kapitel-im-buch-des-lebens.html (eingeladene
Sprecherin)
“7th European summer school on advanced proteomics”, Brixen,
Italien, http://www.proteomic-basics.eu (eingeladene Sprecherin)
Durchführung einer Schulstunde zum Thema “Proteomik” an
verschiedenen schweizer Gymnasien, organisiert im Rahmen des
Projekts “Swiss Life Sciences”
Gastvorlesung an der Universität Utrecht “SRM – an emerging
technology in the field of proteomics”, Utrecht, Niederlande
(eingeladene Sprecherin)