Survey
* Your assessment is very important for improving the work of artificial intelligence, which forms the content of this project
* Your assessment is very important for improving the work of artificial intelligence, which forms the content of this project
KOENZIM DAN KOFAKTOR Dra.Yustini Alioes,MSi,Apt Bagian Biokimia Fakultas Kedokteran Universitas Andalas Padang • Enzim adalah protein yg berfungsi sebagai katalisator (mempercepat reaksi kimia). • Dapat mengalami modifikasi selama reaksi, tetapi kembali ke bentuk asal pd akhir reaksi. • Enzim juga mengatur kecepatan reaksi dlm jalur metabolisme. 2 • Mempunyai aktifitas enzimatik bila berbentuk holoenzim. • Holoenzim = apoenzim + koenzim - apoenzim; protein enzim -koenzim;gugus prostetik/kofaktor 3 Reaksi E = Enzim., S = Substrat., P = Produk 4 Enzim Sebagai Katalisator • Substrat berikatan dgn tempat pengikatan substrat spesifik yg ada pada enzim melalui interaksi dengan residu asam amino enzim. • Daya katalitik enzim berada dalam interval 106 sampai 1014 lebih cepat dibanding reaksi tanpa katalisis. 5 • Suatu enzim hanya bereaksi dgn 1 substrat. • Enzim memerlukan molekul sekunder untuk dapat aktif yg disebut koenzim (non-protein). • Koenzim bertindak sebagai substrate shuttles yg memindahkan berbagai substrat. 6 KOENZIM • • • • Senyawa organik Tahan panas, Mudah terdisosiasi Dpt dipisahkan dari enzimnya dg cara dialisis • Mentranspor ggs kimia/elektron dari 1 enzim ke enzim lainnya • Contoh : NAD,NADP,FAD,FMN,dll 7 • Dpt memperbesar kemampuan katalitik sebuah enzim besar dari kemampuannya sendiri • Jenis reaksi yg sering memerlukan koenzim; - oksidasi reduksi - reaksi pemindahan ggs - isomerasi 8 Perbedaan ENZIM dan KOENZIM Enzim : - Mrpkan biokatalisator - Bersifat termolabil - Spesifik dlm melaksanakan fungsinya - Dpt dirusak oleh logam berat 9 - Aktifitas enzim diukur dg kecepatan reaksi enzimatik - Letak enzim tertentu didalam sel - Hanya mengkatalis 1 macam reaksi 10 • Suatu enzim hanya bereaksi dgn 1 substrat. • Enzim memerlukan molekul sekunder untuk dapat aktif yg disebut koenzim (nonprotein). • Koenzim bertindak sebagai substrate shuttles yg memindahkan berbagai substrat. 11 KOENZIM : - Senyawa organik yg diperlukan utk aktifitas suatu enzim ttt - Bersifat termostabil - Berat molekul rendah - Banyak terdapat pd vit,B Komplek - Bisa dianggap sbg substrat kedua 12 Klassifikasi menurut gugus pemindahannya; A.Ggs pemindahannya yg bukan hidrogen; 1. gula pospat 2. KoA-SH 3. Tiamin piropospat 4. Seny.Folat 5. Biotin 6. Asam lipoat 13 7.Piridosal fosfat 8.Kobamida B.Untuk pemindahan hidrogen; 1, NAD.NADP 2.FMN,FAD 3. Asam lipoat 4. Koenzim 14 • Koenzim biasanya berikatan secara kovalen dengan enzim sehingga sering disebut gugus prostetik. • Gugus prostetik antara lain ialah; - metalloenzim (Co,Cu, Mg, Mn, Se, &Zn) - vitamin B-komplek, seperti; * B-2 pada FMN (Flavin Mononukleotida)& FAD (Flavin Dinukleotida) 15 KOFAKTOR • Kofaktor berfungsi sama dengan gugus prostetik, tetapi berikatan secara reversible • Dpt brp zat anorganikion logam • Dpt brp zat organik .flavin dan heme • Metal- activated enzymes adalah istilah untuk kofaktor ion logam. 16 • Contoh enzim yg mengandung kofaktor; - karbonat anhidrase dg kofaktor Zn terikat sbg bgn dari tapak aktifnya katalitik Pembagian Kofaktor; a.Aktivator ion anorganik yg biasanya berikatan lemah dg suatu enzim Contoh; Cu,Fe,Mn,Zn.Ca,K dan Co 17 B. Ggs Prostetik ikatan kovalen dpt brp seny,organik ttt,vit,atau ion logam Contoh: - FAD Vit,B2/Riboflavinmenerima atom hidrogen - Ion Logam: Sitokromsbg pembawa elektron pd Fe 18 • Fungsi : Membantu proses katalisis oleh enzim maupun penyusunan struktural yg penting utk memantapkan ikatan antara substrat pd enzim atau menstransfer elektron yg timbul selama katalisa 19 Tempat Aktif (active site) • Komplek enzim-substrat berada dalam suatu daerah pada enzim yg disebut tempat aktif. • Terletak di pecahan, celah, atau rongga pada enzim. • Tempat ini juga mengandung koenzim. • Enzim-substrat yg telah diaktifkan membentuk komplek stadium transisi. • Komplek stadium transisi akan terurai menjadi produk. • Enzim bebas kemudian mengikat substrat lain. 20 • Oksidasi = pengurangan elektron / ion H+ • Reduksi = penambahan elektron / ion H+ • Contoh oksidasi: e Fe2+ Fe3+ • Tujuan BO: untuk menghasilkan energi 21 Enzim Oksidoreduktase • • Adalah sekelompok enzim yang terlibat dalam reaksi reduksi-oksidasi Terdiri dari : 1. Oksidase 2. Dehidrogenase 3. Hidroperoksidase 4. Oksigenase 22 1. Oksidase • Mengkatalisis pengeluaran hidrogen dari substrat dgn menggunakan oksigen sebagai akseptor hidrogen. • Enzim-enzim tsb membentuk; - air (H2O) - hidrogenperoksida (H2O2) 23 Enzim Oksidase AH2 ½ O2 AH2 O2 Oksidase A (1) Air H 2O A H2O 2 (2) Hidrogenperoksida 24 Enzim Oksidase 1. Sitokrom oksidase 2. Oksidase dgn flavoprotein; - Asam L-amino oksidase - Xantin oksidase - Glukosa oksidase 25 Sitokrom Oksidase • • Adalah hemoprotein dengan prostetik heme. Enzim ini dapat dirusak oleh: - karbonmonoksida - sianida - hidrogen sulfida gugus 26 Flavoprotein • Kelompok enzim ini memiliki gugus prostetik flavin mononukleotida (FMN) atau flavin adenin dinukleotida (FAD). • Gugus prostetik tsb dibentuk dari riboflavin. 27 2. Dehidrogenase Memiliki 2 fungsi utama: 1. - Memindahkan H dlm reaksi redoks. - Sering memakai koenzim NAD+/NADP+ yg membutuhkan niasin. 2. - Sebagai komponen rantai respirasi. 28 Rangkaian Reaksi Dehidrogenase AH2 Pembawa BH2 (red) (oks) (red) A Pembawa-H2 (oks) A dehidrogenase (red) B (oks) B dehidrogenase 29 3. Hidroperoksidase • • • Kelompok enzim ini melindungi tubuh terhadap peroksida, Karena akumulasi peroksida dapat mencetuskan radikal bebas yg merusak membran sel. Terdiri dari 2 macam enzim: 1. Peroksidase 2. Katalase 30 Peroksidase • Banyak terdapat dalam susu, leukosit, platelet, dan jaringan lain yg terlibat dalam metabolisme eikosanoid. • Hidrogen peroksida direduksi dengan mengorbankan substansi seperti; askorbat, kuinon, & sitokrom C. 31 Peroksidase H2O2 + AH2 2H2O + A 32 Peroksidase Glutation peroksidase dgn gugus prostetik selenium bekerjasama dengan glutation tereduksi melindungi membran lipid & hemoglobin terhadap oksidasi oleh senyawa peroksida. 33 Katalase • • • Enzim ini banyak terdapat dalam; darah, sumsum tulang, membran mukosa, ginjal, dan hepar. Berfungsi menghancurkan H2O2 yang terbentuk oleh kerja oksidase. Katalase & oksidase ini terdapat di dalam peroksisom. 34 Katalase & Oksidase A’H2 AH2 O2 A’ A H2O2 Katalase 2H2O Oksidase H2O2 O2 35 4. Oksigenase • • Enzim dalam kelompok ini mengkatalisis pemindahan & inkorporasi (penyatuan) oksigen ke dalam molekul substrat. Terdiri dari: - Dioksigenase - Monooksigenase 36 Dioksigenase • • Penyatuan molekul O2 ke substrat. Terdiri dari: 1. Enzim yg mengandung Fe, seperti; - homogentisat dioksigenase 2. Enzim yg menggunakan heme, seperti; L-triptofan dioksigenase (triptofan pirolase) dalam hepar 37 Monooksigenase • Penyatuan hanya satu atom molekul O ke dalam substrat. • Atom O lainnya direduksi menjadi air. 38 Monooksigenase Sitokrom P450 • • • Enzim ini terdapat dalam mikrosom sel hepar. Membutuhkan NADH & NADPH untuk dioksidasi dalam reaksi yang disebut siklus hidroksilase. Penting untuk hidroksilasi obat-obatan 39 Adenosin Trifosfat (ATP) • • • • Adalah nukleotida trifosfat yg mengandung adenin, ribosa, & 3 gugus fosfat. Agar dapat bekerja, ATP membentuk komplek Mg2+. ATP mengandung 2 gugus fosfatberenergi tinggi & sebuah fosfat berenergirendah (ikatan ester biasa). Gugus fosfat berenergi-tinggi dilambangkan sebagai P 40 Adenosin Trifosfat (ATP) NH2 N N N Mg2+ O-O P O N O- O P O OO P O CH O O OH OH 41 Metabolisme • Reaksi katabolisme (eksergonik) ialah; Pemecahan atau oksidasi molekul bahan bakar. • Reaksi anabolisme (endergonik) ialah; Reaksi sintesis berbagai substansi. • Jadi, Metabolisme ialah; Kombinasi proses katabolik dan anabolik. 42 Metabolisme Suatu proses endergonik tidak dapat berjalan sendiri, tetapi harus menjadi komponen suatu sistem eksergonik-endergonik yg berpasangan, sehingga keseluruhan perubahan (netto) bersifat eksergonik. bersih 43 Siklus ATP/ADP • • • Berperan untuk menghubungkan prosesproses yg menghasilkan P-berenergi-tinggi dgn proses yg menggunakan P-berenergitinggi. ATP dikonsumsi & dibentuk kembali secara kontinu. Depot ATP/ADP sangat kecil, sehingga hanya cukup untuk mempertahankan jaringan aktif dlm waktu beberapa detik saja. 44 Siklus ATP/ADP ATP CO2 Pernapasan: pembentukan energi dari; - karbohidrat - lemak - protein Penggunaan energi: - biosintesis makromolekul - kontraksi otot - transpor ion aktif - termogenesis O2 ADP + Pi 45 Sumber Utama P-berenergi-tinggi 1. Fosforilasi oksidasi; -Sumber P terbesar dlm organisme aerobik. -Energi bebasnya berasal dari oksidasi rantai respirasi. 2. Glikolisis; -Pembentukan dua P dari hasil katalisis fosfogliserat kinase & piruvat kinase. 3. Daur Krebs; -Satu P-berenergi-tinggi dibentuk pada tahap suksinil tiokinase. 46 Produk ATP pada Fosforilasi Oksidatif • • • Diperkirakan satu ATP disintesis setiap dua proton melewati tonjolan . Hasilnya ialah; - 3 mol. ATP utk oksidasi 1 mol. NADH - 2 mol. ATP utk oksidasi 1 mol. FADH2 Laju fosforilasi oksidatif dikendalikan oleh; NADH, oksigen, ADP 47 ATP Sintase 48 Kepustakaan • Marks, DB., Marks, AD., Smith CM. Basic medical biochemistry: a clinical approach. 1996. Dalam: B.U. Pendit, penerjemah. Biokimia Kedokteran Dasar: Sebuah Pendekatan Klinis. Eds. J. Suyono., V. Sadikin., L.I. Mandera. Jakarta: EGC, 2000 • R.K. Murray, D.K. Granner, P.A. Mayes, V.W. Rodwell Harper’s Biochemistry. 27th ed. McGraw-Hill Companies, New York. 2006. 49