Download Svoboda_Petr

G – Personální zabezpečení - přednášející
JU v Českých Budějovicích
PřF
Název VŠ / součásti
Název SP
Jméno a příjmení
Petr Svoboda
Tituly
1974
jp.
4
Rok narození
typ vzt.
rozsah
Další současní zaměstnavatelé
typ prac. vztahu
Ústav molekulární genetiky AV ČR, v.v.i.
pp.
Přírodovědecká fakulta UK
jp.
Přednášky v předmětech
Epigenetics
Údaje o oboru vzdělání na VŠ a o praxi od absolvování VŠ, vč. studia v doktorském SP
Mgr. Ph.D.
do kdy
rozsah
40
14
1211
vzdělání na VŠ
Přírodovědecká fakulta UK / biologie / 1995 Bc.
Přírodovědecká fakulta UK / vývojová biologie /1997 Mgr.
University of Pennsylvania, Philadelphia, USA / Molecular and cellular biology / 2002 Ph.D.
praxe od absolvování VŠ
01/2003 – 09/2003 postdoc - University of Pennsylvania, Dept. of Biology, Philadelphia, PA, USA
10/2003 – 12/2006 postdoc - Friedrich Miescher Institute, Novartis Forschunstiftung, Basel, Switzerland
01/2007 – dosud - vedoucí oddělení - Ústav molekularní genetiky, AV ČR, Vídeňská 1083, Praha 4-Krč
01/2007 – dosud - asistent - Katedra buněčné a vývojové biologie PřF UK, Viničná 7, Praha 2 - Vinohrady
Přehled o publikační a další tvůrčí činnosti za posledních 5 let
Svoboda P. and Di Cara A. (2006) Hairpin RNA - a secondary structure of primary importance. Cell Mol Life Sci. 63 (2006) 901–918.
Horman S.R., Svoboda P., Luning Prak E.T. (2006) The potential regulation of L1 mobility by RNA interference. J Biomed
Biotechnol. 2006 (2006), Article ID 32713.
Bultman S.J., Gebuhr T.C. , Pan H., Svoboda P., Schultz R.M., and Magnuson T. (2006) Maternal BRG1 regulates zygotic genome
activation in the mouse. Genes Dev 20 (13):1744-54.
Puschendorf M., Stein P., Oakeley E.J., Schultz R.M., Peters A.H., Svoboda P. (2006) Abundant transcripts from retrotransposons are
unstable in fully grown mouse oocytes. Biochem Biophys Res Commun. 347(1):36-43.
Schmitter D., Filkowski J., Sewer A., Pillai R.S., Oakeley E.J., Zavolan M., Svoboda P., Filipowicz W. (2006) Effects of Dicer and
Argonaute down-regulation on mRNA levels in human HEK293 cells. Nucleic Acids Res. 34(17):4801-15
Svoboda P. (2007) Off-targeting and other non-specific effects of RNAi experiments in mammaliancells. Curr Opin Mol Ther.
Jun;9(3):248-57.
Grosshans H. , Svoboda P. (2007) miRNA, siRNA, piRNA – Kleine Wiener Ribonukleinsauren. Bioessays, 29(9):940-3.
Svoboda P. (2008) RNA silencing in mammalian oocytes and early embryos. Curr Top Microbiol Immunol. 320:225-56.
Sinkkonen L., Hugenschmidt T., Berninger P., Gaidatzis D., Mohn F., Artus-Revel C.G., Zavolan M., Svoboda P., Filipowicz W.
(2008) MicroRNAs control de novo DNA methylation through regulation of transcriptional repressors in mouse embryonic stem cells.
Nat Struct Mol Biol. 15(3):259-67.
Kutter C, Svoboda P. (2008) miRNA, siRNA, piRNA: Knowns of the unknown. RNA Biol. 5(4):181-8.
Svoboda P. (2008) microRNAs in Stem Cells, Controlling Pluripotency and Differentiation. Bioforum Europe 2008; 11: 28-29
Svoboda P., Stein P. (2009) RNAi Experiments in Mouse Oocytes and Early Embryos. CSH Protocols 2008;3(12):
doi/10.1101/pdb.top56
Svoboda P. (2009) Preparation of dsRNA for Microinjection Experiments in Mouse. CSH Protocols 2008;3(12): doi/10.1101/
pdb.prot5131
Svoboda P. (2009) Cloning a Transgene for Transgenic RNAi in Mouse Oocytes. CSH Protocols 2008;3(12):
doi/10.1101/pdb.prot5134
Flemr M, Ma J, Schultz RM, Svoboda P. (2010) P-Body Loss Is Concomitant with Formation of a Messenger RNA Storage Domain
in Mouse Oocytes. Biol Reprod. 82(5), 1008-1017
Ma J., Flemr M., Stein P., Berninger P., Malik R., Zavolan M., Svoboda P., and Schultz R.M. (2010) MicroRNA Activity Is
Suppressed in Mouse Oocytes, Current Biology 20 (3), 1-6.
Sarnova L, Malik R, Sedlacek R, Svoboda P. Shortcomings of short hairpin RNA-based transgenic RNA interference in mouse
oocytes. J Negat Results Biomed. 2010 Oct 12;9:8.
Sinkkonen L, Hugenschmidt T, Filipowicz W, Svoboda P. Dicer is associated with ribosomal DNA chromatin in mammalian cells.
PLoS One. 2010 Aug 13;5(8):e12175.
Svoboda P, Flemr M. The role of miRNAs and endogenous siRNAs in maternal-to-zygotic reprogramming and the establishment of
pluripotency. EMBO Rep. 2010 Aug;11(8):590-7.
Svoboda P. Why mouse oocytes and early embryos ignore miRNAs? RNA Biol. 2010 Sep-Oct;7(5):559-63.
Flemr M, Svoboda P. Ribonucleoprotein localization in mouse oocytes. Methods. 2011 Feb;53(2):136-41.
Působení v zahraničí
07/1998 – 12/2002 PhD student - teaching assistant (1998-2000), research assistant (2000-2002)
University of Pennsylvania, Philadelphia, USA / Molecular and cellular biology / 2002 Ph.D.
01/2003 – 09/2003 postdoc
University of Pennsylvania, Dept. of Biology, Philadelphia, PA, USA
10/2003 – 12/2006 postdoc
Friedrich Miescher Institute, Novartis Forschunstiftung, Basel, Switzerland
Obor
habilitačního
nebo Molecular and cellular biology
jmenovacího řízení nebo udělení
vědecké hodnosti
2002
Rok udělení (Ph.D.)
Podpis přednášejícího
řízení na VŠ
datum
ohlasy publikací
mezinár.
tuzem.
1513
20.5.2011