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ED BIO SORBONNE PARIS CITE
Proposition de sujet de thèse à l’appui d’une demande de contrat doctoral 2017-2018
Renseignements relatifs à l’Unité de Recherche :
Label et intitulé : : Unité Inserm U1151
Nom et prénom du Directeur : Xavier Nassif
Téléphone :
09 66 81 03 99
Télécopie :
Courriel: [email protected]
Renseignements relatifs à l’Equipe :
Nom de l’Equipe d’Accueil : Equipe Plasticité du génome et infection
Nom et prénom du responsable : Arbibe Laurence
Qualité du responsable : Chef d’équipe-DR2 INSERM
Téléphone :
01 72 60 64 30
Télécopie :
Courriel : [email protected]
Renseignements relatifs au sujet de thèse :
Nom et prénom du Directeur de thèse (HDR) : Arbibe Laurence
Qualité : Chef d’équipe-DR2 INSERM
Téléphone :
01 72 60 64 30
Télécopie :
Courriel : [email protected]
Titre du sujet proposé :
(En français) Décryptage de nouveaux mécanismes bactériens induisant de l’instabilité génomique dans
la cellule épithéliale
(En anglais) : Decrypting new bacterial mechanisms causing genomic instabillity into host epithelial cell
Département (cocher le département correspondant au sujet de thèse qui n’est pas obligatoirement le
vôtre) :
 Biologie Cellulaire et moléculaire, Physiologie et Physiopathologie
 Immunologie
 Développement Génétique Neurobiologie et Vieillissement
 Infectiologie, Microbiologie
Summary (5 lines maximum) :
Our research is focused on the mechanisms by which bacteria induce DNA damage into host epithelial
cells and promote genomic instability into the gut. We have recently identified a novel bacterial
genotoxin encoded by various enterobacteria species. The PhD project aims at decrypting the mechanisms
by which this novel toxin leads to genotoxicity into host, and its impact on host cell genomic stability.
Proposition de sujet de thèse à l’appui d’une demande de contrat doctoral 2017-2087
(L’ensemble de cette fiche ne doit pas dépasser 1 page)
Nom, prénom du directeur de l'unité de recherche : Xavier Nassif
Numéro de l'unité de recherche (et établissement de rattachement) : Inserm U1151 Institut Necker
Enfants Malades
Nom, prénom du responsable de l'équipe d'accueil (EAD) : Arbibe Laurence
Nom, prénom du directeur de thèse : : Arbibe Laurence
Titre du sujet de thèse proposé : : Decrypting new bacterial mechanisms causing genomic instabillity into
host epithelial cell
(en anglais)
Citer 5 mots clés : enterobacteria, genotoxin, genomic instability, DNA repair, cancer
(key words)
Candidat pressenti :
OUI
Contenu scientifique du programme de la thèse (en anglais)
Our research is focused on the mechanisms by which bacterial stress imposed by commensal or
pathogenic bacteria can shape chromatin information and destabilize the epigenome and genome in the
gut. In this context, the PhD project is centered on the bacterial mechanisms promoting intestinal genomic
instability through the injection of bacterial proteins causing DNA damage into host cells. Our bacterial
model is the entero-invasive pathogen Shigella. Shigella species are subgenus of E. coli strains that have
acquired a specific set of genes that contribute to the Shigella pathotype. We previously showed that
Shigella caused DNA damage into host enterocytic cells (1). Shigella induced DNA double strand breaks
into epithelial cells, both in vitro and in vivo in the colon. Importantly, Shigella-infected cells are unable
to stabilize the oncogene p53, a master regulator of the DNA repair response. The defective engagement
of the p53 DNA repair in the context of a genotoxic stress constitutes a paradigm by which bacteria can
predispose to genetic instability. We have recently identified the Shigella toxin causing genotoxicity
(paper submitted). Therefore, the present PhD project will aim at decrypting the mechanisms by which
this novel toxin leads to genotoxicity into host, and its impact on host cell genomic stability. The
experimental program will document the mechanisms of cellular delivery and trafficking of the toxin into
the nucleus of infected cells, and the consequences on host cell physiology, with a particular interest for
the identification of mutagenic and tumorigenic potencies. The experimental strategies will rely on cell
biology and molecular biology approaches in the context of host-bacterial pathogen interaction
(1) J. Bergounioux et al., Calpain activation by the Shigella flexneri effector VirA regulates key steps in
the formation and life of the bacterium's epithelial niche. Cell Host Microbe 11, 240–252 (2012).
Indiquez les cinq meilleures publications récentes de l’équipe :
Jean Bergounioux, Ruben Elisee, Anne-Laure Prunier, Françoise Donnadieu, Brice Sperandio, Philippe Sansonetti
and Laurence Arbibe. Calpain Activation by the Shigella flexneri Effector VirA Regulates Key Steps in the
Formation and Life of the Bacterium’s Epithelial Niche.
Cell Host Microbe 2012 11, 240–252
Habiba Harouz, Christophe Rachez, Benoit M. Meijer, Benoit Marteyn, Françoise Donnadieu , Florence Cammas,
Christian Muchardt, Philippe Sansonetti and Laurence Arbibe. Shigella flexneri targets the HP1 subcode through
the phosphothreonine lyase OspF.
EMBO J 2014 22 : 2606-2622
Habiba Harouz, Christophe Rachez, Benoit Meijer, Christian Muchardt, Laurence Arbibe.
Targeting of chromatin readers: a novel strategy used by the Shigella flexneri virulence effector OspF to reprogram
transcription. Microbial Cell 2015, Volume 2, Issue 1, pp. 1 - 32, January
Benoit M. Meijer, Suk Min Jang, Ida C. Guerrera, Cerina Chhuon, Joanna Lipecka, Caroline Reisacher, Françoise
Baleux, Philippe J. Sansonetti, Christian Muchardt and Laurence Arbibe. Threonine eliminylation by bacterial
phosphothreonine lyases rapidly causes crosslinking of MAPK in live cells J Biol Chem 2017, in press.